バイオインフォマティクスの臨床応用

次世代シーケンサー等の計測技術の飛躍的な発展により、臨床現場から得られる病原体のゲノムデータは膨大かつ複雑化しています。これらのデータを迅速かつ正確に解釈し、医療上の意思決定に役立てるためには、情報科学による高度な解析技術が必要不可欠です。計算機科学を駆使して医療や生命科学の課題を解決する分野はバイオインフォマティクスと呼ばれ、現在その臨床応用への期待がますます高まっています。私はその中でも特に、臨床現場で重要な病原細菌を対象とし、大規模なゲノム配列データと統計的手法を組み合わせた、迅速かつ高精度な菌種同定手法の研究を行っています。情報科学における最先端のアルゴリズムを微生物ゲノムへと応用することで、臨床診断のプロセスを革新し、医療現場に直結する新しいデータ解析基盤の構築を目指しています。
そのほか、情報科学的手法を駆使して、腸内細菌メタゲノム、量子コンピューティングの活用、薬剤耐性菌の比較ゲノム解析、プラスミドを介した耐性遺伝子の伝播ネットワーク解析といった様々な研究トピックスについて幅広い興味を持って研究を行っています。